Vedere immagini mediche DICOM con Linux
Da qualche tempo in alcuni ospedali le immagini mediche come: radiografie, risonanze magnetiche e altri esami, vengono dati in forma digitale su cd/dvd.
Inutile dirlo, che il software viewer Medstation allegato funziona solo su Windows ed è piuttosto indirizzato a geek medici più che ai pazienti.
Il software per DICOM
Dopo un po' di ricerche su software che supportassero immagini mediche DICOM, sono arrivato ad aeskulap e devo dire che l'usabilità di questo software sono davvero notevoli, se non migliori di quello per Windows.
Fortunatamente aeskulap è pacchettizzato, per Ubuntu / Debian (quindi scaricate il deb) oppure per Gentoo.
Le immagini che ho sono in formato dicom3 e senza entrare nei dettagli, non sono immagini normali perché sono in qualche modo "georeferenziate": ogni spostamento su un livello dell'immagine può anche essere visualizzato sulle altre.
[img_assist|nid=414|title=dicom aeskulap|desc=|link=node|align=right|width=200|height=150]
Utilizzo
Nel cd fornito dall'ospedale, dovrebbe esserci una cartella IMAGES aprite quella, abitate "any files" (per qualsiasi estensione) e selezionate tutte le image
Le immagini che vengono caricate non corrispondono necessariate a quelle che vedete nei riquadri perché potrebbero essere più livelli associati alla stessa immagine.
Per visualizzare gli eventuali livelli di un'immagine potete cliccare sulla barra di scorrimento o usare la rotellina del mouse e se avete abilitato anche i riferimenti potete vedere dove si inserisce quell'immagine nelle altre viste.
Altri software
Prima di arrivare a questo software funzionante, ne ho provati altri alcuni neanche pacchettizzati da Debian (purtroppo).
Uno di questi è Amide, che malgrado il suo supporto multi formato non è stato in grado ad aprire le immagini.
Se vi interessa, su Ubuntu l'ho installato così:
# conversione
sudo alien amide-0.8.16-1.i386.rpm -d
sudo alien volpack-1.0c4-1.i386.rpm -d
# installazione
apt-get instal libdcmtk1
dpkg -i
# sistemazione dei link
cd /usr/lib
ln -s libfame-0.9.so.0 libfame-0.9.so.1
ln -s libdcmdata.so.1 libdcmdata.so
ln -s libofstd.so.1 libofstd.so
e' un prodott bellissimo, ed
e' un prodott bellissimo, ed è stato ultimamente integrato con tools, rimozione dell'osso etc, molto interessanti, pensate solo che un programma del genere viene venduto come optional assieme a TC multislice a circa 70k.



Tra i radiologi pare sia
Tra i radiologi pare sia molto popolare OsiriX, open source per Mac OS X. Lo provai tempo fa e, da profano, mi parve molto elegante.
http://homepage.mac.com/rossetantoine/osirix/Index2.html
Blau/monsterlippa