Tra i tanti video editor per Linux, mi sento di consigliarne solo 2.

Kdenlive
Ha un'interfaccia molto ricca di funzionalità, è multitraccia, è facile tagliare i video e riassemblarli,ecc.. ma non mi digerisce l'audio :(

Kino
Malgrado il nome è gtk, l'interfaccia è molto semplice, non fa molte cose che il programma di sopra promette di fare, ma almeno mi mantiene l'audio nei video tagliati :)